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️ Episódio 5: Previsão de Parto Prematuro — Perfis de Nucleossomos de cfDNA no Plasma
Neste episódio do Base por Base, exploramos o trabalho de Guo et al. (2025) em PLOS Medicine, que demonstra como pegadas nucleossômicas de cfDNA no plasma podem antecipar o risco de parto prematuro. Os autores conduziram um estudo caso-controle multicêntrico envolvendo 2.590 gestações entre 12 e 28 semanas de gestação, aplicando sequenciamento de genoma inteiro e análise de cobertura em regiões promotoras (−1 a +1 kb ao redor do TSS). Utilizando quatro modelos de aprendizado de máquina e duas estratégias de seleção de características, foi desenvolvido o classificador PTerm, baseado em SVM, que obteve AUC de 0,849 em coortes de validação interna e externa com alta sensibilidade e especificidade, sem exigir alterações nos procedimentos de NIPT ou custos adicionais .
Destaques do estudo:
O promoter profiling de cfDNA reflete o status de expressão de suas células de origem, evidenciando diferenças significativas entre gestações pré-termo e a termo .
O classificador PTerm incorporou 83 genes com perfis de cobertura diferencial em regiões promotoras, alcançando AUC de 0,878 no treinamento e 0,849 na validação .
PTerm demonstrou desempenho robusto nas três coortes independentes, com AUCs variando de 0,812 a 0,845 e precisão geral de 85,3% .
A integração de PTerm com variáveis clínicas (IMC pré-gestacional e fração fetal) via kernel não linear manteve a elevada capacidade preditiva, sem aumento de custos .
Análises de enriquecimento funcional revelaram que genes-chave estão associados à apoptose, sinalização de oxitocina e respostas imunes, sugerindo mecanismos biológicos subjacentes ao parto prematuro .
Conclusão:
O estudo de Guo et al. estabelece o promoter profiling de cfDNA como método não invasivo e de baixo custo para identificação precoce de gestações em risco de parto prematuro, configurando um avanço promissor para a implementação clínica de estratégias preventivas e monitoramento personalizado .
Referência:
Guo, Z., Wang, K., Huang, X., Li, K., Ouyang, G., Yang, X., et al. (2025). Genome-wide nucleosome footprints of plasma cfDNA predict preterm birth: A case-control study. PLOS Medicine, 22(4): e1004571. https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1004571
Licença:
Este episódio é baseado em um artigo de acesso aberto publicado sob a licença Creative Commons Attribution License (CC BY) – http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
